Об увольнении Филина стало известно в июле прошлого года. Тогда генеральный директор ГАБТа Владимир Урин заявил, что не будет продлевать контракт с Филиным. Объяснение этому он дал весьма туманное: "Непродление контракта с Филиным связано с делами внутренней жизни театра". Однако расставаться с Филиным насовсем Урин не собирался и тогда заявил, что предложит экс-худруку балета другую должность. Как стало известно позже, Филин будет возглавлять мастерскую молодых хореографов.
"Вопрос сегодня с молодыми хореографами стоит очень остро, и поэтому мы давно задумали создать молодежную хореографическую программу, такую же, как у нас уже существует и довольно успешно работает оперная. Мастерская молодых хореографов даст возможность проявить себя начинающим талантливым хореографам и солистам", – объяснил Урин.
Впрочем, замены Филину на посту худрука балета Большого театра не будет – с 18 марта 2016 года эта должность прекратит свое существование. Вместо него будет учреждена должность директора балетной труппы ГАБТа, аналогом которой является должность артистического директора в других оперных и балетных домах мира. Ее займет артист и хореограф, балетмейстер Ла Скала Махарбек Вазиев.
Сергей Филин занял должность художественного руководителя балетной труппы Большого театра в марте 2011 года. В январе 2013 года на Филина было совершено нападение – ему плеснули кислотой в лицо. Артист был госпитализирован с ожогами лица и глаз и перенес несколько десятков операций.